Détection de QTL de résistance a la pasteurellose

La pasteurellose est la première cause de mortalité des femelles en élevage cunicole. Lors du projet RELAPA, 964 lapins de 6 lignées ont été inoculés à l’âge de 6 semaines avec une souche pyogène de Pasteurella multocida et leur réponse à l’infection a été suivie pendant 14 jours. Différents caractères de résistance à la pasteurellose ont été enregistrés. Parmi ces lapins, 921 ont été génotypés avec la puce lapin contenant près de 200 000 marqueurs SNP (single nucleotide polymorphism). Après contrôle qualité, de 82 353 à 107 539 SNP ont été conservés suivant les lignées, et 919 lapins (de 137 à 175 lapins par lignées) ont été retenus pour les études d’association pangénomique. Le logiciel GEMMA a été utilisé, en appliquant un modèle mixte animal utilisant une régression linéaire pour chaque SNP. Au total, 93 SNP, répartis sur 9 chromosomes et dans 5 lignées, sont associés à des caractères de résistance à la pasteurellose ou de croissance pré-sevrage.